Bộ rễ là tiêu chuẩn đầu tiên và cũng rất quan trọng nhầm đánh giá vẻ đẹp của 1 cây Bonsai. Dấu hiệu của tuổi tác cổ lão thể hiện qua gốc rễ, nó tạo cho người xem một ấn tượng về sự bào mòn của thời gian.
 |
| Bộ rễ cây nguyệt quới Bonsai |
Khi chọn rễ làm mặt tiền cho cây Bonsai, nên chọn hướng có rễ phô ra đẹp nhất, các rễ lan tỏa đều về các hướng, tránh tình trạng rễ chỉa thẳng vào hướng nhìn ngắm cây Bonsai. Các vết sẹo hay bọng thân không nên chọn làm mặt chính cho cây Bonsai.
